El software Análisis Clínicos Net, así como el software por internet Análisis Clínicos Web, permiten la generación y expedición de Comprobantes fiscales digitales por internet CFDI.

El software permite generar facturas directamente desde el folio de la solicitud; o bien, combinar varios folios para generar una sola factura con el sumarizado de exámenes y subtotales. Esta función es útil cuando se generan facturas para empresas, donde se sumarizan los exámenes pero se detallen los nombres de los empleados que acudieron por exámenes de laboratorio.

Las facturas generadas por el sistema son timbradas por un Proveedor Autorizado de Certificación PAC, registrado ante el SAT, a fin de proveer la validez fiscal del documento XML generado. Las facturas expedidas se generan en formato XML y PDF, para que puedan ser enviadas por email de forma rápida, sencilla y automatizada.